培养博士生的工作从本教研室成立的第一天起就全面开展。起初，所有的博士生都是由斯米尔诺夫教授直接指导的。后来，斯米尔诺夫教授除了指导自己的博士生，还负责严格监督所有博士生培养计划的完成情况。结果，该系几乎所有的博士生都按时，甚至提前通过了博士论文答辩。
历史上，本教研室培养了大量的俄罗斯本地的专家。很多来自意大利、印度、埃及、保加利亚、中国、伊拉克、尼泊尔、阿富汗、波兰、南斯拉夫、墨西哥、蒙古等国家的地质学家也在本教研室进行博士研究生阶段的学习并获得了博士学位。
目前斯塔拉斯金教授、阿夫多宁教授、杰尔加乔夫教授、博古斯拉夫斯基副教授、布尔米斯特洛夫副教授为博士生导师。
该系的所有研究生都有自己的工作台，有储存样本的空间，可以使用莫斯科大学的分析设备，可以在系里的电脑上处理所有的图件和数据。简而言之，博士研究生拥有从事专门研究工作的所有条件。
博士研究生入学需要通过以下考试：
- 专业方向课；
- 哲学；
- 外语。